NVIDIA, Google DeepMind и исследовательские партнеры опубликовали предсказанные структуры белковых комплексов для более чем 2800 вирусов в базе данных AlphaFold Database. Структуры были выведены с помощью AlphaFold2 с использованием инструментов NVIDIA для масштабирования работы. NVIDIA также опубликовала рабочий процесс, использованный для создания этого датасета.
Что было предоставлено в открытый доступ
NVIDIA описывает сотрудничество с участием Google DeepMind и EMBL-EBI, в рамках которого предсказанные комплексы вирусных белков добавляются в базу данных AlphaFold Database. В работе используется AlphaFold 2 наряду с вычислительными инструментами NVIDIA и открытым пайплайном для предсказания структур.
Релиз включает информацию об уровне достоверности, помогающую исследователям оценивать предсказания. Открытие доступа к датасету позволяет другим ученым изучать предложенные структуры и выбирать направления для дальнейших исследований.
От предсказания к эксперименту
Спрогнозированная структура представляет собой гипотезу о молекулярном строении. Сама по себе она не доказывает биологическое взаимодействие, не валидирует препарат и не определяет метод лечения. Для проверки научных выводов, сделанных на основе этих моделей, по-прежнему необходимы экспериментальные исследования.
Первоисточник
В этом отчете кратко изложен материал указанного ниже источника. Аналитика приводится отдельно; заявления о продуктах и исследованиях атрибутируются их авторам.
Читать оригинал на NVIDIA